Guanosin-3′,5′-bispyrophosphat

Strukturformel
Allgemeines
Name	Guanosin-3′,5′-bispyrophosphat
Andere Namen	ppGpp; Guanosin-5′,3′-tetraphosphat;
Summenformel	C10H17N5O17P4
Externe Identifikatoren/Datenbanken
ECHA-InfoCard	Vorlage:Wikidata-Einbindung
PubChem	766
DrugBank	DB04022
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Eigenschaften
Molare Masse	603,16 g·mol−1
Aggregatzustand	fest
Sicherheitshinweise
	GHS-Gefahrstoffkennzeichnung; keine Einstufung verfügbar
	GHS-Gefahrstoffkennzeichnung; keine Einstufung verfügbar
	Soweit möglich und gebräuchlich, werden SI-Einheiten verwendet. Wenn nicht anders vermerkt, gelten die angegebenen Daten bei Standardbedingungen.

Guanosin-3′,5′-bispyrophosphat, oder ppGpp ist das Signalmolekül einer bakteriellen Stressantwort, der sogenannten stringent response. Es ist ein Derivat des Guanosindiphosphats, das am 3'-Atom der Ribose eine zusätzliche Pyrophosphatgruppe trägt.

ppGpp wurde zuerst in Escherichia coli entdeckt. In E. coli ist ppGpp ein Indikator für Nährstoffmangel.

ppGpp Kreislauf

Strukturformel des Vorläufermoleküls pppGpp.

In E. coli wird das Vorläufermolekül pppGpp von zwei ppGpp-Synthetasen aus ATP und GTP hergestellt, RelA und SpoT. RelA kann zudem direkt ppGpp herstellen. Eine 5'-Phosphohydrolase^[2] spaltet den Phosphatrest von pppGpp ab. RelA ist an die Ribosomen gebunden, fungiert als Sensor für unbeladene tRNAs und synthetisiert pppGpp bei Aminosäuremangel.^[3] SpoT ist ein cytosolisches Protein^[4] und synthetisiert pppGpp bei Glukosemangel.^[5] Im Gegensatz zu RelA baut SpoT ppGpp zu Pyrophosphat und GDP ab.^[6] Die DNA-Sequenzen der relA- und spoT-Gene von E. coli sind ähnlich, somit handelt es sich um paraloge Gene. Im N-terminus finden sich jedoch Unterschiede, die sogenannte HD-Domäne; die in Hydrolasen vorkommt, ist im relA-Gen mutiert.^[7] Deswegen kann RelA ppGpp nicht abbauen.

Funktion

ppGpp bindet an die RNA-Polymerase^[8] und hat einen tiefgreifenden Effekt auf die Transkription verschiedener Gene. Es verringert die Transkriptionsrate an rRNA-Genen und induziert die Transkription von Genen, die an der Aminosäurebiosynthese beteiligt sind. ppGpp ist ein globaler Regulator der Genexpression in E. coli.^[9]

ppGpp in anderen Bakterien

Im Gegensatz zu E. coli und vielen anderen Bakterien verfügen manche Bakterien, z. B. Bacillus subtilis und viele andere grampositive Bakterien, nur über eine einziges ppGpp metabolisierendes Enzym, das ppGpp herstellt und abbaut.^[10] In vielen pathogenen Bakterien spielt ppGpp eine wichtige Rolle als globaler Regulator der Genexpression. Bei diesen Bakterien ist ppGpp sogar als Virulenzfaktor identifiziert:

Mycobacterium tuberculosis^[11]
Legionella pneumophila^[12]
Pseudomonas aeruginosa^[13]
Borrelia burgdorferi^[14]
Vibrio cholerae^[15]
Listeria monocytogenes^[16]
verschiedene Brucella-Arten.^[17]^[18]

Somit stellt die ppGpp-Synthese einen bisher nicht identifizierten, möglichen Angriffsort für neuartige Antibiotika dar. In Streptomyces coelicolor und anderen Streptomyceten ist ppGpp für Antibiotikabiosynthese notwendig.^[19]
Bei Rhizobien ist ppGpp essentiell für die Symbiose zwischen Bakterium und Pflanze und für die Stickstofffixierung.^[20]^[21] Bei Archaeen wurde ppGpp bisher nicht nachgewiesen.

ppGpp in Pflanzen

ppGpp kommt auch in Pflanzen vor. Es wird in den Chloroplasten synthetisiert und spielt ebenfalls eine wichtige Rolle bei der Adaptation an veränderte Umweltbedingungen.^[22]

Literatur

↑ Dieser Stoff wurde in Bezug auf seine Gefährlichkeit entweder noch nicht eingestuft oder eine verlässliche und zitierfähige Quelle hierzu wurde noch nicht gefunden.
↑ Keasling, JD. et al. (1993): Guanosine pentaphosphate phosphohydrolase of Escherichia coli is a long-chain exopolyphosphatase. In: PNAS 90(15), 7029–7033, PMID 8394006; PMC 47069 (freier Volltext, PDF).
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↑ Takahashi K, Kasai K, Ochi K. Identification of the bacterial alarmone guanosine 5'-diphosphate 3'-diphosphate (ppGpp) in plants. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101, 4320-4324, 2004 PMID 15010537

[NV-1] Dieser Stoff wurde in Bezug auf seine Gefährlichkeit entweder noch nicht eingestuft oder eine verlässliche und zitierfähige Quelle hierzu wurde noch nicht gefunden.

[2] Keasling, JD. et al. (1993): Guanosine pentaphosphate phosphohydrolase of Escherichia coli is a long-chain exopolyphosphatase. In: PNAS 90(15), 7029–7033, PMID 8394006; PMC 47069 (freier Volltext, PDF).

[3] Haseltine., W. und Block, R. (1973): Synthesis of guanosine tetra- and pentaphosphate requires the presence of a codon-specific, uncharged transfer ribonucleic acid in the acceptor site of ribosomes. In: PNAS 70(5), 1564–1568, PMID 4576025; PMC 433543 (freier Volltext, PDF).

[4] Gentry, DR. und Cashel, M. (1995): Subcellular localization of the Escherichia coli SpoT protein. In: J. Bacteriol. 177(13), 3890–3893, PMID 7601859; PMC 177113 (freier Volltext, PDF).

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[17] Dozot M, Boigegrain RA, Delrue RM, Hallez R, Ouahrani-Bettache S, Danese I, Letesson JJ, De Bolle X, Kohler S. The stringent response mediator Rsh is required for Brucella melitensis and Brucella suis virulence, and for expression of the type IV secretion system VirB. Cell. Microbiol. 2006 PMID 16803581

[18] Kim S, Watanabe K, Suzuki H, Watarai M. Roles of Brucella abortus SpoT in morphological differentiation and intramacrophagic replication. Microbiology. 151, 1607-1617, 2005 PMID 15870469

[19] Martinez-Costa OH, Arias P, Romero NM, Parro V, Mellado RP, Malpartida F. A relA/spoT homologous gene from Streptomyces coelicolor A3(2) controls antibiotic biosynthetic genes. J. Biol. Chem. 271, 10627-10634, 1996 PMID 8631867

[20] Moris M, Braeken K, Schoeters E, Verreth C, Beullens S, Vanderleyden J, Michiels J. Effective symbiosis between Rhizobium etli and Phaseolus vulgaris requires the alarmone ppGpp. J. Bacteriol. 187, 5460-5469, 2005 PMID 16030240

[21] Calderon-Flores A, Du Pont G, Huerta-Saquero, A, Merchant-Larios H, Servin-Gonzalez L, Duran S. The stringent response is required for amino acid and nitrate utilization, nod factor regulation, nodulation, and nitrogen fixation in Rhizobium etli. J. Bacteriol. 187, 5075-5083, 2005 PMID 16030199

[22] Takahashi K, Kasai K, Ochi K. Identification of the bacterial alarmone guanosine 5'-diphosphate 3'-diphosphate (ppGpp) in plants. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101, 4320-4324, 2004 PMID 15010537

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